נמצא כי להתעמלות הגופנית שברכיבה על אופניים יש קשר לבריאות טובה יותר ולהרגשת רווחה מוגברת. על פי דו"ח של ארגון הבריאות העולמי, חוסר פעילות גופנית הוא הגורם השני רק לעישון, בגרימת מחלות בארצות מפותחות, דבר הגורם להוצאות אדירות לחברה. הדו"ח של ארגון הבריאות העולמי קובע כי הגברת הפעילות הגופנית הוא המרשם הטוב ביותר לבריאות הציבור וכי רכיבה על אופניים היא "פעילות מתאימה ביותר" למטרה זו. ארגון הצדקה ההנדסי הבריטי "ססטרנס" דיווח כי ההחזר בהשקעה חברתית באופניים ובפיתוח דרכים להגברת הרכיבה עליהם, הוא ביחס של 20:1 בהוצאות בריאות ותועלות חברתיות אחרות. מחקר שהתפרסם בירחון לרפואה פנימית ואשר נעשה בדנמרק בשנת 2000, מצא כי רכיבה על אופניים למקום העבודה, מפחיתה ב-40% את סיכוני התמותה הידועים.

הרכיבה כפעילות גופנית אירובית: רכיבה על אופניים, אופני הרים אופני כביש או בכלל, היא פעילות גופנית אירובית. הרכיבה מערבת בעיקר את המערכת הקרדיו-וסקולארית. במהלך הרכיבה עובדות קבוצות שרירים גדולות ורבות, וכאשר הרכיבה מקיימת את שלושת התנאים הבאים (רכיבה בדופק מטרה - 80%-60% מהדופק המרבי, מעל 4 פעמים בשבוע, ולפחות חצי שעה בכל פעם) - הרי שרכיבה על אופניים כפעילות אירובית מורידה את רמת הכולסטרול הרע וריכוז שומני הדם

הרכיבה מונעת נזקים במערכת התנועה: תנועת הריצה שקיבלה חיזוק רציני בתחילת שנות ה- 70 גרמה להרבה נזקים ופציעות ספורטיביות בגפיים התחתונות. מאחר שפעולת הרכיבה על האופניים נעשית כשמשקל הגוף של הרוכב על האופניים והעומס קטן יחסית - הרי שהנזק למפרקים בטווח הארוך הוא מינימאלי. רכיבה על אופניים מתאימה אפוא לבעלי ספקטרום רחב של משקלים. רצים רבים שסבלו מבעיות במערכת התנועה, או רצים עם בעיות אורטופדיות, עשו הסבה מקצועית ועברו לאופניים.

רכיבת אופניים  מפעילה מערכות שונות של הגוף: באופן אירובי ואנאירובי, והיא משפרת את הכוח, הסיבולת וכושר לב-ריאה. מחקרים מראים שרכיבה במשך מספר שבועות בקביעות משפרת את הכושר הגופני.

הרכיבה על אופניים מורידה את רמות הכולסטרול: ומעלה את היחס שבין הכולסטרול הטוב HDL)) לכולסטרול הרע (LDL).

הרכיבה עוזרת להוריד את לחץ הדם: ולכן מפחיתה את הסיכון לתחלואה שנגרמת כתוצאה מיתר לחץ דם – ואת קצב הלב במנוחה.

הרכיבה מונעת ומפחיתה לחצים: כמו כל פעילות גופנית, הרכיבה משפרת את הההרגשה הכללית ומפחיתה סטרס. היא מעלה את רמת האנרגיה, תורמת לשינה טובה יותר ומשפרת את הבריאות הנפשית.

הרכיבה מעלה את קצב חילוף החומרים: דבר שמסייע בהרזיה. בנוסף, שורפים יותר קלוריות, מפני שניתן להמשיך בפעילות זמן רב יותר לעומת פעילויות כמו ריצה.

הרכיבה מחזקת את העצמות.